Gli uffici della Presidenza Nazionale della L.N.I. si trovano nella sede di Roma, in Via Guidubaldo Dal Monte, 54.  Ad eccezione della Rivista “Lega Navale” e dell’Ufficio Comunicazione e Promozione – che dipendono rispettivamente dal Presidente e dal Vice Presidente – tutti gli uffici sono alle dipendenze del Direttore Generale, che ne dirige il funzionamento, regolato dall'ordinamento dei servizi, approvato a norma di legge. Il personale dipendente è impiegato nei vari uffici secondo le proprie qualifiche e capacità, in armonia con le attribuzioni previste dal mansionario di ciascuna qualifica.